Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- e -

• E : codon.h
• edit_op_t : prnt.h
• EIMOV : dna.cpp
• eliminateSameAndSimple() : uniqueshortseq.cpp
• Emptied() : oldbionj.c
• encoding : splice.cpp , sim4b1.cpp , sim4b1.h
• END_SIG : sim4.h
• entropy() : seqhelper.cpp , seqhelper.h
• erase() : util.cpp , util.h
• errorMessageFix1() : GenModel.cpp , GenModel.h
• EST : RNAModel.h
• EST_GEN : sim4.h
• ESTs : README.combest
• example : README_group
• Example : README
• existFile() : combest.cpp
• Exon : sim4.h
• exon_cores() : sim4b1.cpp
• exon_list : sim4b1.cpp
• Exon_ptr : sim4.h
• exonid : nrep.cpp
• exonOverlapLengthManyToOne() : GenModel.cpp
• expandCombination() : matrix.cpp , matrix.h
• expdist() : expdist.c
• expdist_() : expdist.c
• expectedStop() : doublestop.cpp
• EXTEND_BW : sim4b1.cpp
• extend_bw() : sim4b1.cpp
• extend_fw() : sim4b1.cpp
• EXTEND_FW : sim4b1.cpp
• extend_hit() : sim4b1.cpp
• extendBack() : alnexon.cpp
• extendFront() : alnexon.cpp
• extractInt() : strformat.h , strformat.cpp
• extractInter() : intergenic.cpp