Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- g -

• G : codon.h
• G_score : sim4b1.cpp
• gap() : helper.c , helper.h
• GAP_AA_CHR : MSPcrunch.h
• gen_align() : alnfn.h , gen_align.c
• GEN_EST : sim4.h
• GEN_LOG4_ENTRIES : sim4b1.cpp
• GENBANK : seqaln.h
• GENERIC : bioseq.h
• genomic_log4s : sim4b1.cpp
• get_argval() : args.cpp , args.h
• get_cargval() : args.cpp , args.h
• get_edist() : sim4b1.cpp
• get_fargval() : args.cpp , args.h
• get_match_quality() : sim4b1.cpp
• get_msp_threshold() : sim4b1.cpp
• get_stats() : sim4b1.cpp
• get_strargval() : args.cpp , args.h
• get_sync_flag() : sim4b1.cpp
• getAccField() : head.cpp , head.h
• getAllInt() : strformat.cpp , strformat.h
• getCandidateDatabase() : doublestop.cpp
• getClusterMembers() : breakcl.cpp
• getcount() : mlocalS_str.cpp
• getDbsFromFile() : doublestop.cpp
• getf() : head.cpp , head.h , gbfn.cpp , gbfn.h
• getfield() : gbprt2ace.cpp
• getField() : head.cpp , head.h , gbfn.cpp , gbfn.h
• getGenomicSeq() : testGModel.cpp
• getGsubArchiveFiles() : gbresub.cpp
• getInput() : estsep.cpp , seqdiv.cpp , seqsep.cpp , g2a.cpp
• getInputFiles() : gb2ace.cpp , gdna2a.cpp , gprt2a.cpp
• getInputFromRawGmap() : combest.cpp
• getInputFromRawSam() : combest.cpp
• getinslen() : chimeradetect_mysql.cpp
• getInt() : strformat.cpp , strformat.h
• getlinktab() : nrep.cpp , gathercaiwegene.cpp
• getLongIntrons() : wolm.cpp
• getLower() : strformat.cpp , strformat.h
• getmaxS() : getbest.c
• getminS() : getbest.c
• getModelprt() : gwseedaln.cpp
• getnrPrt() : gwseedaln.cpp
• getNumber() : strformat.cpp , strformat.h , strformat.cpp , strformat.h
• getOldGsub() : gbresub.cpp
• getOrgid() : LoadCDSFromAce.java
• getOrgidString() : LoadCDSFromAce.java
• getPep() : tabaln.cpp , tabaln_same.cpp
• getPrt() : dbaln.cpp , dbaln_cds.cpp , dbaln_fungal.cpp , dbaln_nr.cpp , gwseedaln.cpp
• getPrtByModelId() : gwseedaln.cpp
• getpvalue() : getpvalue.c
• getQuery() : blpurify.cpp , blpur.cpp
• getQueryLen() : blpur.cpp
• getRoot() : hatrees.h
• getSeqStartIdx() : alignment.cc
• getTargetProtein() : chimeradetect_mysql.cpp
• getTblFiles() : gbresub.cpp
• gettop() : getbest.c
• getUnusedId() : LoadCDSFromAce.java
• GFSR() : GFSR.h , GFSR.c
• gfsr_() : GFSR.c
• GFSRnormal : GFSR.c
• GFSRstate : GFSR.c
• GFSRtable : GFSR.c
• GLOBAL : dynaln.h , seqaln.h , dynaln.h , seqaln.h
• globalD() : globalD.c
• globalS() : globalS.c
• good : subcluster.cpp , alignment.h
• good_ratio() : sim4b1.cpp , sim4b1.h
• goodQuality() : pickorthodiv.cpp
• grab() : clusmethod.cc , clusmethod.h
• gray : Esambl.h
• greedy() : sim4b1.cpp
• GrishinDistance() : Evolution.h
• group() : README_group
• group</a >() : README__group.html
• groupModel() : gathergene.cpp , gathercaiwegene.cpp
• growZero() : Coverdepth.cpp
• gt : splice.cpp , splice.h
• gtint() : wolm.cpp
• guess : README_group
• guessGmapOutputFile() : combest.cpp
• guessSAMOutputFile() : combest.cpp