Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- t -

• T : codon.h
• table2map() : gbresub.cpp , dbalnhelper.h , dbalnhelper.cpp
• table2pair() : dbalnhelper.cpp , dbalnhelper.h
• table2vector() : dbalnhelper.h , dbalnhelper.cpp
• tableExists() : chimeradetect_mysql.cpp , dbalnhelper.cpp , dbalnhelper.h , buildjgitranscript.cpp
• tableFillMap() : dbalnhelper.cpp , dbalnhelper.h
• tableFillMapFirst() : dbalnhelper.h , dbalnhelper.cpp
• tandalign : gen_align.c
• tanddelseq1 : gen_align.c
• tanddelseq2 : gen_align.c
• TANDEM : seqaln.h
• tandem_gen() : gen_align.c
• tandnexti : gen_align.c
• tandnextj : gen_align.c
• tandprevi : gen_align.c
• tandprevj : gen_align.c
• taxonomy : README
• TEMP : sim4.h
• TEST_BLOCK_COUNT : driver.cc
• TEST_BLOCK_LEN : driver.cc
• testAdvance() : testExon.cpp
• testBaseProfile() : testExon.cpp
• testBreakup() : testGModel.cpp
• testcodon() : testseq.cpp
• testDip() : testExon.cpp
• testFindORF() : testseq.cpp
• testFromFile() : testEsambl.cpp
• testIntersect() : testExon.cpp
• testLoad() : testseq.cpp
• testLongestNMissingORF() : testseq.cpp
• testLongestORF() : testseq.cpp
• testLongestPlus() : testseq.cpp
• testmodel() : testExon.cpp
• testOperator() : testExon.cpp
• testOverlap() : testExon.cpp
• testRange() : testExon.cpp
• teststddev() : testlib.cpp
• testsubchain() : testExon.cpp
• testTranslate() : testseq.cpp
• TEXT : seqaln2gapos.cpp
• therefore : README
• thesis : ref.h
• tilingMinus() : GenModel.cpp
• tilingMinusLength() : GenModel.cpp
• tilingPlus() : GenModel.cpp
• tilingPlusLength() : GenModel.cpp
• times : README
• toDelimitedString() : buildlocusinfo.cpp
• toLower() : seqdiv.cpp , seqsep.cpp
• tonumber() : dumpcds.cpp
• topfp() : picktopfootprint.cpp , mergefootprint.cpp
• topscore() : topscore.c
• toString() : strformat.h
• toTable() : chimeradetect_mysql.cpp
• TOTALF : fqtable.h
• TOTALQ : fqtable.h
• toupper() : util.h , util.cpp
• tr() : strformat.h , strformat.cpp
• trace() : trace.c , alnfn.h
• translate() : bioseq.h , bioseq.cpp
• trim() : strformat.cpp , strformat.h , breakcl.cpp
• trimLeadingSpace() : strformat.h , strformat.cpp
• trimN() : cleanshort.cpp
• trlocalS() : trlocalS.c
• trlsdeclump() : trlsdeclump.c
• trrpt_alignment() : trrpt_alignment.c
• trrpt_scores() : trrpt_scores.c
• trtrace() : trtrace.c
• TRUE : sim4.h
• type : README