- b -

• bcd2num() : util.h , util.c , util.h
• before() : astyping.cpp
• Best_pair() : oldbionj.c
• bestincol() : bestincol.c
• bestinrow() : bestinrow.c
• bestORF() : testGModel.cpp
• bld_table() : sim4b1.cpp , sim4b1.h
• bmatch() : sim4b1.cpp
• bootstrap() : dbaln_fungalbt.cpp
• bothADAA() : astyping.cpp
• Branch_length() : oldbionj.c
• breakExtraModel() : Esambl.cpp
• breakonecl() : breakcl.cpp
• breakString() : strformat.cpp , strformat.h
• brkpt() : util.h , util.c , util.h
• bufferAheadTargetProteins() : chimeradetect_mysql.cpp
• bufferAllProteins() : dbaln_fungalrmsimp.cpp
• bufferGenomic() : dbaln_fungal.cpp , dbaln.cpp , dbaln_cds.cpp , dbaln_nr.cpp
• bufferGenomicFromFile() : pfogfile.cpp
• bufferProtein() : dbaln_fungalrmsimp.cpp , dbaln_fungalbt.cpp , dbaln_fungal.cpp
• bufferProteins() : pfog.cpp , pfogmultipledb.cpp
• bufferProteinSeq() : rmsimpmatch.cpp , compnr2gentropy.cpp
• bufferProteinsFromFile() : pfogfile.cpp , pfog.cpp , pfogmultipledb.cpp
• bufferQueryProteins() : chimeradetect_mysql.cpp
• bufferQueryProteinsVector() : chimeradetect_mysql.cpp
• bufferTargetProteins() : chimeradetect_mysql.cpp
• bufferTargetProteins2() : chimeradetect_mysql.cpp
• buildGeneCluster() : nrep.cpp
• buildGeneInfo() : buildjgitranscript.cpp